测序数据中的两个基因之间的相关性

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来源 : 哔哩哔哩时间：2023-08-08 19:32:03

(资料图片仅供参考)

最近在做单细胞测序的基因相关性分析，毕竟真小白，之前也没做过，就去网上找，发现没有，只有一篇大佬写的，但我觉得作图很奇怪，我就自己到处乱查一通，有了自己的新分析方法哈哈哈哈哈哈，这篇就记录一下怎么分析两个基因之间的相关性吧。

首先就是TCGA和RNAseq的，两个差不多，网上也有很多教程，这边就随便搞了一下

然后就是单细胞测序的，我一开始是参考了这个大佬的

/p/9850c4d88a67

但散点图，这样每个点代表一个细胞，由于又是count出来的图就奇奇怪怪

如下：

所以，我想起我以前看过的文献单细胞测序的基因相关性散点图，图上一个点代表一个细胞

于是我就开始自己创作：

这个相关性不好，原理就是把scRNAseq变成了RNAseq，统计肿瘤细胞群中每个样本的每个基因平均表达量，然后再看基因相关性。

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